中藥丸有水丸（原含水率45％）、水蜜丸（30％）、蜜丸（20％）和濃縮丸（20％）之分需要烘干到含水率為6％-8％，中藥丸干燥還需保持藥性，丸型要圓，藥丸表面需光滑，不能有裂紋，并且藥丸溶解時間要短，無菌等特殊要求，中藥丸物料粘稠度大，導熱性差，中藥丸微波烘干殺菌設備可以避免常規蒸汽干燥熱傳導差的問題，但如果微波輸入功率不協調，藥丸內部過熱，氣壓力過大，也會使藥丸干燥過程中爆裂和焦化。因此，微波干燥也需根據不同質地，大小含水率等制定不同的烘干工藝。 
中藥丸微波烘干殺菌設備工藝特征，把烘干區段分為若干段，這樣就可以在烘干的同時始終將溫度控制在60-80度左右，不會產生開裂和焦糊。
在藥品生產中，為了保證藥品的均勻度和良好的流動性，常將原料用一定的方法制成顆粒(藥丸、膠囊、片劑)。利用微波的熱效應和非熱效應，進行低溫干燥和殺菌處理，微波能量直接輻射到藥品中，使藥品內部溫度升高，產生壓力，加速被約束水分子的轉移，被處理物品中的水份逐步向外蒸發，此時微波設備中再進行抽濕，將蒸發出來的水份帶走。利用微波干燥處理藥品不僅大大提高產品質量，并可大大縮短干燥時間和節約大量的能源，經濟效益十分明顯。
可對各種中、西藥品、藥材進行干燥、脫水、消毒、滅菌、殺蟲、防霉處理。可大大方便生產廠家對藥品和原材料的貯存和保管。